4月15日，中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究员与晁彦杰研究员、复旦大学生物医学研究院陈振国教授、军事科学院军事医学研究院高月研究员团队合作，在Nature Communications上发表题为“A widely conserved protein Rof inhibits transcription termination factor Rho and promotes Salmonella virulence program”的研究论文，首次阐明了Rof蛋白抑制Rho因子依赖型转录终止，并调控沙门氏菌毒力因子表达的分子机制。该研究为深入研究致病菌毒力因子表达调控机制提供了新线索，为抗菌药物研发提供了新靶点。

Rho因子依赖型转录终止（Rho dependent transcription termination）是普遍存在于细菌中的一类转录终止机制。与固有转录终止不同，Rho因子依赖型转录终止主要通过具有5′ ->3′转移酶/解旋酶活性的Rho因子完成RNA聚合酶转录终止过程，同时与转录翻译偶联过程相互协作，在细菌应激基因表达、外源基因沉默、毒力因子调控、维持基因组稳定性等过程起着重要调控作用。细菌Rho因子依赖型转录终止过程主要包括四个步骤：1）Rho解旋酶形成开环状态（Ring state）六聚体，并通过其初始RNA结合位点（Primary binding site，PBS）识别信使RNA上的特殊序列（Rho utilization site，rut site）并与信使RNA结合；2）开环状态Rho六聚体通过其中心位置第二个RNA结合位点（Secondary binding site，SBS）与富含嘧啶RNA序列结合；3）开环状态六聚体闭合形成闭环六聚体（Ring state），并通过水解ATP提供能量沿着5’->3’方向在信使RNA上移动；4）Rho解旋酶六聚体接近延伸状态RNA聚合酶，并通过NusG转录因子介导与RNA聚合酶结合，通过水解ATP提供机械力解离信使RNA与RNA聚合酶，最终完成RNA聚合酶的转录终止过程。王程远研究组在此前的研究过程中成功解析了转录因子NusG介导细菌转录翻译偶联（Science 2020）以及Rho因子依赖型转录终止（Nature 2023）的分子机制，阐明了其相互协作调控基因表达的工作模型。然而，细菌中Rho因子依赖型转录终止过程是否还受到其它因子的调控仍未明确。